RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 CCL11P51671 97 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CHAF1BQ13112 559 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 UGT8Q16880 541 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GPR87Q9BY21 358 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ARGFXA6NJG6 315 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 VCLP18206 1134 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 IDSP22304 550 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CCNCP24863 283 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PTPN4P29074 926 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ACY1Q03154 408 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GALNT2Q10471 571 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MMRN1Q13201 1228 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GPR18Q14330 331 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CHRNA6Q15825 494 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CPZQ66K79 652 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SYVN1Q86TM6 617 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PRR7Q8TB68 274 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MAML1Q92585 1016 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ING2Q9H160 280 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RAD18Q9NS91 495 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CDK14O94921 469 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TIAF1O95411 115 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 DDAH2O95865 285 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 HLA-DQB2P05538 268 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GJC1P36383 396 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CD86P42081 329 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 HALP42357 657 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GALNT3Q14435 633 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 KCNAB1Q14722 419 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 QPCTQ16769 361 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CCNYQ8ND76 341 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 UBXN4Q92575 508 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GLYATL1Q969I3 302 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ANO10Q9NW15 660 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.027e-32■□□□□ 8.2
ACTN4-211ENST00000589528 CHUKO15111 745 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 VEGFDO43915 354 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 DPM1O60762 260 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 MTX2O75431 263 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 MX2P20592 715 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 IL4RP24394 825 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 DCDC1P59894 354 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 GTF2H3Q13889 308 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 IHHQ14623 411 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 PLCL1Q15111 1095 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 KLHL35Q6PF15 583 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 GPR26Q8NDV2 337 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 GDAP1Q8TB36 358 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 MR1Q95460 341 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 BTBD6Q96KE9 485 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms