RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 INSCQ1MX18 579 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PCID2Q5JVF3 399 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CES3Q6UWW8 571 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX20Q7Z614 316 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NAGSQ8N159 534 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL14Q8N4G2 192 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL10Q8N8L6 244 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK15Q8TD08 544 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CPT1BQ92523 772 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF592Q92610 1267 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RANBP9Q96S59 729 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 WASF3Q9UPY6 502 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 AGAP14A8MT82 685 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 H7C0S8 307 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 AP3B1O00203 1094 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1DO15297 605 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 B4GAT1O43505 415 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-CO3P00414 261 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 POLBP06746 335 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR89BP0CG08 455 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RALBP11234 206 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK4P11802 303 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GLB1P16278 677 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TPSB2P20231 275 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGALP20701 1170 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NMBRP28336 390 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 FNTAP49354 379 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CTSCP53634 463 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1D5P58170 312 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK16Q00536 496 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNG1Q06432 222 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMB3Q13751 1172 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP8Q14114 963 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ11Q14654 390 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TPSAB1Q15661 275 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR33Q49SQ1 333 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 HES3Q5TGS1 186 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CASC4Q6P4E1 433 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 IYDQ6PHW0 289 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 AMZ2Q86W34 360 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NXPE1Q8N323 547 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MPP5Q8N3R9 675 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4L1Q8NH43 312 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NAT6Q93015 286 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ULK4Q96C45 1275 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT12Q99456 494 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 COPS8Q99627 209 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms