RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	LAMA1	P25391	3075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563		A0A1W2PQF6	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TULP2	O00295	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	AP5Z1	O43299	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KAT7	O95251	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCNK5	O95279	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IL33	O95760	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KLKB1	P03952	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	LPL	P06858	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HMBS	P08397	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GABRG2	P18507	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CD58	P19256	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PON1	P27169	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KLK7	P49862	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NDST1	P52848	882 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC5A3	P53794	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MFAP3	P55082	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CUL2	Q13617	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SYCP1	Q15431	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TWIST1	Q15672	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563		Q6ZVL8	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PIGK	Q92643	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KAT5	Q92993	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	PTPRB	P23467	1997 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	EPHB6	O15197	1021 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRP3	O75074	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATG13	O75143	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	TULP3	O75386	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	NFATC1	O95644	943 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPM3	P06753	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	MTHFD2	P13995	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	GATA3	P23771	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANXA13	P27216	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	YWHAQ	P27348	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	USP8	P40818	1118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	P2RY2	P41231	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	NUMB	P49757	651 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	LIMK1	P53667	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	SCAND1	P57086	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPRD1A-205	ENST00000587563	GRM3	Q14832	879 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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