RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 USP49Q70CQ1 688 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF563Q8TA94 476 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 AKAP12Q02952 1782 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SSX4O60224 188 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MMP10P09238 476 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 LINC00032P0C843 101 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GLRA2P23416 452 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MIPP30301 263 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GJB7Q6PEY0 223 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SYNE4Q8N205 404 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 C8orf48Q96LL4 319 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ABCB9Q9NP78 766 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 BPNT1O95861 308 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 PGAM2P15259 253 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF823P16415 610 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 HTR1BP28222 390 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 APLP1P51693 650 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TDGQ13569 410 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 DLG2Q15700 870 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SYT4Q9H2B2 425 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MYNNQ9NPC7 610 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 FPGTO14772 594 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 LIASO43766 372 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 KERAO60938 352 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 XYLBO75191 536 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MAGEA6P43360 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ADGRE1Q14246 886 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 NDUFA9Q16795 377 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 C16orf46Q6P387 395 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 EXOC2Q96KP1 924 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 DNAJB5O75953 348 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GLDCP23378 1020 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CBR4Q8N4T8 237 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SEC14L1Q92503 715 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 OTUB2Q96DC9 234 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SOHLH2Q9NX45 425 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 MAGP20916 626 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 PRKAG1P54619 331 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 FOXO4P98177 505 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.05□□□□□ -1.6
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SMG1-211ENST00000565324 WNT8BQ93098 351 aa5.05□□□□□ -1.6
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SMG1-211ENST00000565324 C21orf2O43822 256 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC37A4O43826 429 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CCNB2O95067 398 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 IFNA4P05014 189 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 GNAZP19086 355 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 SLC7A1P30825 629 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 CTBP2P56545 445 aa5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMG1-211ENST00000565324 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.05□□□□□ -1.6
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