RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SHE	Q5VZ18	495 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC8	Q6A555	127 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM6	Q6P461	480 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM270	Q6UE05	265 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF329	Q86UD4	541 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCH	Q86VS3	1027 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CPXM2	Q8N436	756 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3C6	Q969F1	213 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TEKT1	Q969V4	418 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK1	Q96PY6	1258 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAM1	Q96QH2	718 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLPB	Q9H078	707 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP27	Q9H306	513 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1456	Q9P272	454 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PEMT	Q9UBM1	199 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KL	Q9UEF7	1012 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	UTY	O14607	1347 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTCH2	Q04721	2471 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WYN8	130 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PR77	199 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC34	A8MYJ7	566 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGRF2	O14827	1237 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HBP1	O60381	514 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL41	O60662	606 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TACC1	O75410	805 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TADA2A	O75478	443 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG6	O75602	509 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A12	O75746	678 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TPPP	O94811	219 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT7	O95251	611 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAU	P00749	431 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GBA	P04062	536 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT8	P05787	483 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	INHBA	P08476	426 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR89B	P0CG08	455 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	UROS	P10746	265 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4B1	P13584	511 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G2A	P14555	144 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FER	P16591	822 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DRD1	P21728	446 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNC	P24863	283 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MC5R	P33032	325 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ST8SIA6	P61647	398 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALNT1	Q00973	533 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	STIM1	Q13586	685 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DPYS	Q14117	519 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PDK1	Q15118	436 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96

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