RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559389.1

SNX1-206, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 753 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-206ENST00000559389 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CFAP36Q96G28 342 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CFAP99D6REC4 459 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 GRID2O43424 1007 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 RALBP11234 206 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CD59P13987 128 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CTSEP14091 401 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 ARHGAP8P85298 464 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 LRP8Q14114 963 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 PACS1Q6VY07 963 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 ZNF547Q8IVP9 402 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 SLC25A45Q8N413 288 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 GPR150Q8NGU9 434 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 LMX1AQ8TE12 382 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 TTC25Q96NG3 672 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 BOCQ9BWV1 1114 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 CLPBQ9H078 707 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 DMDP11532 3685 aa21.39■■□□□ 1.02
SNX1-206ENST00000559389 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 FLRT2O43155 660 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 SGTAO43765 313 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CTSCP53634 463 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 C1orf61Q13536 156 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ELOCQ15369 112 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 BCL7AQ4VC05 210 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CCDC25Q86WR0 208 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 IFT20Q8IY31 132 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 IFT81Q8WYA0 676 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CERS2Q96G23 380 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 FMO2Q99518 471 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 TTC1Q99614 292 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 FAM186AA6NE01 2351 aa21.39■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 OR2AG2A6NM03 316 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 LMO7DNF2Z398 122 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GIMD1P0DJR0 217 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 NSG1P42857 185 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 TTPAP49638 278 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 23.2
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SNX1-206ENST00000559389 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 TCEA2Q15560 299 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 INAVAQ3KP66 663 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 NEPROQ6NW34 567 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 DET1Q7L5Y6 550 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 KCNMB4Q86W47 210 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 KMOO15229 486 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ACP5P13686 325 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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SNX1-206ENST00000559389 PRLHRP49683 370 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CTBSQ01459 385 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 NRROSQ86YC3 692 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 NAXDQ8IW45 347 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 CALML6Q8TD86 181 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX1-206ENST00000559389 NAT14Q8WUY8 206 aa21.37■■□□□ 1.01
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