RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 C1RP00736 705 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 MTHFD2P13995 350 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CSF2RAP15509 400 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 PRKACGP22612 351 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 IL12AP29459 219 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GGT5P36269 586 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 OPRL1P41146 370 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GSTM4Q03013 218 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 AQP6Q13520 282 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CASP10Q92851 521 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 MYLPFQ96A32 169 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GALPQ9UBC7 116 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 HCSTQ9UBK5 93 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 A8MU76 341 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CFAP99D6REC4 459 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CBFA2T3O75081 653 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 LDLRP01130 860 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 ALBP02768 609 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CD1DP15813 335 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 ACADVLP49748 655 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GALNT3Q14435 633 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 POLE4Q9NR33 117 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TMEM247A6NEH6 219 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CAPN15O75808 1086 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 COL6A1P12109 1028 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 HSD17B1P14061 328 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 LBPP18428 481 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 BRCC3P46736 316 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GATMP50440 423 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 DGKQP52824 942 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 RAD23AP54725 363 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 MGAT3Q09327 533 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 XAF1Q6GPH4 301 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 OR2T11Q8NH01 316 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CCDC126Q96EE4 140 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 TRIM15Q9C019 465 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 NTN4Q9HB63 628 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 INVSQ9Y283 1065 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 MYO7AQ13402 2215 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-214ENST00000543184 GABRDO14764 452 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CDH3P22223 829 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PNPLA4P41247 253 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CLCN5P51795 746 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PLA2G16P53816 162 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 DNASE1L3Q13609 305 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PTPRRQ15256 657 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FBXO30Q8TB52 745 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TMBIM1Q969X1 311 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TSGA13Q96PP4 275 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 DOK1Q99704 481 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CDC7O00311 574 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 NFKBIAP25963 317 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PIGAP37287 484 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 MOGQ16653 247 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 KDELC1Q6UW63 502 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 GID8Q9NWU2 228 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 U3KQV3 271 aa14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms