RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 RIMKLBQ9ULI2 386 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRK-222ENST00000532751 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC78A2IDD5 438 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 OR5K4A6NMS3 321 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP99D6REC4 459 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SNX2O60749 519 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TCEA3O75764 348 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CA5AP35218 305 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PAFAH1B1P43034 410 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NPY2RP49146 381 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF547Q8IVP9 402 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NXPE1Q8N323 547 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 PSMA3P25788 255 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TERF1P54274 439 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R7Q15435 360 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PATE1Q8WXA2 126 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 GATA6Q92908 595 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PEX13Q92968 403 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 54.9
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 RNF14Q9UBS8 474 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 OR2AG2A6NM03 316 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 IDSP22304 550 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEA6P43360 314 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CTSCP53634 463 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KCNJ11Q14654 390 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 AMZ2Q86W34 360 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CREG2Q8IUH2 290 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CCNJLQ8IV13 435 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SFRP1Q8N474 314 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRK-222ENST00000532751 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SLC23A2Q9UGH3 650 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0G2JNG1 304 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ACRV1P26436 265 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CASQ1P31415 396 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 FASLGP48023 281 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CCL7P80098 99 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KIR2DS5Q14953 304 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 IYDQ6PHW0 289 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 DET1Q7L5Y6 550 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SPRED1Q7Z699 444 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA9Q86WD7 417 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 OR13J1Q8NGT2 312 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL33A6NCF5 533 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CSO75390 466 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 EML2O95834 649 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 GPR3P46089 330 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ARSDP51689 593 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEP78395 509 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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