RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 AGAP6Q5VW22 663 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DCAF15Q66K64 600 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 USP43Q70EL4 1123 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC103Q8IW40 242 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SETD6Q8TBK2 473 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 PIK3R3Q92569 461 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LGALS12Q96DT0 336 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 C3orf30Q96M34 536 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 AGAP4Q96P64 663 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM209Q96SK2 561 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FICDQ9BVA6 458 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DUSP16Q9BY84 665 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DUSP21Q9H596 190 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GLOD4Q9HC38 313 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 POLG2Q9UHN1 485 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.47□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TSC2P49815 1807 aa7.46□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A087WZ62 844 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 AGAP5A6NIR3 686 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CENPXA8MT69 81 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PTGES3LE9PB15 166 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TOR1BO14657 336 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GABRDO14764 452 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HAT1O14929 419 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 XYLBO75191 536 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 LRIG2O94898 1065 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 C1RP00736 705 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 UROSP10746 265 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRNB1P11230 501 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 EDNRBP24530 442 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ARNTP27540 789 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RCVRNP35243 200 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ADRA1AP35348 466 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PLK1P53350 603 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HUNKP57058 714 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SH3BP2P78314 561 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IL5RAQ01344 420 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CDK5R2Q13319 367 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PWP1Q13610 501 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GRB7Q14451 532 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAPK11Q15759 364 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NPTX1Q15818 432 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKS6Q68DC2 871 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ISCA2Q86U28 154 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf74Q86VG3 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IPMKQ8NFU5 416 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NDNFQ8TB73 568 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PEX13Q92968 403 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MBOAT4Q96T53 435 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IL12RB2Q99665 862 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC32Q9BV29 185 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ALG9Q9H6U8 611 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KLQ9UEF7 1012 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DSEQ9UL01 958 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 LCTP09848 1927 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RLFQ13129 1914 aa7.46□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NRCAMQ92823 1304 aa7.45□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms