RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFA1Q9NP55 256 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf141Q9NUB4 165 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC38A7Q9NVC3 462 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERAP1Q9NZ08 941 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDAQ9Y2T3 454 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DERAQ9Y315 318 aa0.74□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATRXP46100 2492 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VWA3AA6NCI4 1184 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLCO1B7G3V0H7 640 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF4O00268 1085 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LDLRAD4O15165 306 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLK10O43240 276 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCNT3O95395 438 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV4-59P01825 116 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFAP2AP05549 437 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 URODP06132 367 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIPFP07098 398 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MELTFP08582 738 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT1A1P22309 533 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADD2P35612 726 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBA7P41226 1012 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLCSP50747 726 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP15P51511 669 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THOP1P52888 689 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A2Q01362 244 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXO1Q12778 655 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LY6DQ14210 128 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VEPH1Q14D04 833 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF11Q15544 211 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TADA2BQ86TJ2 420 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR180Q86V85 440 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC47A2Q86VL8 602 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GBGT1Q8N5D6 347 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC185Q8N715 623 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF383Q8NA42 475 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T12Q8NG77 320 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASL10AQ92737 203 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSMCE3Q96MG7 304 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMC6Q96SB8 1091 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRB3Q9BUF7 120 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLITRK2Q9H156 845 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARFGAP3Q9NP61 516 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT4Q9NZJ9 180 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NTNG1Q9Y2I2 539 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM96BQ9Y3D0 163 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEPT1Q9Y6K0 416 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa0.73□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UMODL1Q5DID0 1318 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSGN1A6NI15 193 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHISA7A6NL88 538 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0YIN7 160 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSPG5O95196 566 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C22orf31O95567 290 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSTBP04080 98 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPIP06744 558 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT19P08727 400 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM49P0CI25 452 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM49CP0CI26 452 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACADMP11310 421 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL4RP24394 825 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OPRL1P41146 370 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTHFRP42898 656 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSCP56915 257 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFNB1P98172 346 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CALCOCO2Q13137 446 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDGQ13569 410 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C15orf32Q32M92 178 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTXN3Q4LDR2 81 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALS2CLQ60I27 953 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM81Q6P7N7 255 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM198BQ6UWH4 519 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPPA4Q7L190 304 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLD3Q8IV08 490 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8NBF4 154 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TYMSOSQ8TAI1 123 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACOX2Q99424 681 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF577Q9BSK1 485 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOD2Q9HC29 1040 aa0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms