RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACVR1CQ8NER5 493 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUP37Q8NFH4 326 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4C3Q8NH37 302 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHBDF1Q96CC6 855 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUCLG2Q96I99 432 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHCHD5Q9BSY4 110 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 COQ3Q9NZJ6 369 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMOD4Q9NZQ9 345 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLLQ9UGP5 575 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHLDB1Q86UU1 1377 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0U1RQS6 177 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A17O43808 307 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLK8O60259 260 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 VENTXO95231 258 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CER1O95813 267 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MT-ND5P03915 603 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYC1P08574 325 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM200BP0CF97 657 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYBL2P10244 700 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYL1P12980 280 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTM2P28161 218 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RYKP34925 604 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIR3DL2P43630 455 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMPHP49418 695 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CREB5Q02930 508 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR17Q13304 367 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAZQ16635 292 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 GXYLT1Q4G148 440 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAXCQ5TGI0 409 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC31Q6UY01 552 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SESTD1Q86VW0 696 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 EID3Q8N140 333 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF175Q8N4F7 328 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PARP16Q8N5Y8 322 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 OLIG1Q8TAK6 271 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGCLL1Q8TB92 370 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D16Q8TBP0 767 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR66Q8TBY9 1149 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K3Q99759 626 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLX1AQ9BQ83 275 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOL2Q9BQE5 337 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC28BQ9BUN5 200 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB126Q9BYW3 111 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 C22orf23Q9BZE7 217 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPC7Q9HCX4 862 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FANCLQ9NW38 375 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF212Q9UDV6 495 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC4EQ9ULY5 219 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSG11Q9UQ72 335 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LTBP4Q8N2S1 1624 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC105371242A0A075B767 164 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 VWA3AA6NCI4 1184 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 EBAG9O00559 213 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRDO14764 452 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 COQ9O75208 318 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3BGRLO75368 114 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR1BP28222 390 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 BDKRB2P30411 391 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAX9P55771 341 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDR2Q01850 454 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRG2Q64ET8 278 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGZQ86VD9 579 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LONP2Q86WA8 852 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFAND4Q86XD8 727 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALHM3Q86XJ0 350 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNT15Q8N3T1 639 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARNTL2Q8WYA1 636 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 HPS3Q969F9 1004 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 C18orf8Q96DM3 657 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 QRFPRQ96P65 431 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RANBP9Q96S59 729 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D23Q9NUY8 699 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC38A7Q9NVC3 462 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms