RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 MT-CO3P00414 261 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CASQ1P31415 396 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 AKT1P31749 480 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 VPS41P49754 854 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CACNG1Q06432 222 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 BIRC2Q13490 618 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 KCNJ11Q14654 390 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 PPP1R7Q15435 360 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 INSCQ1MX18 579 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CCDC38Q502W7 563 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 PERM1Q5SV97 790 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 HES3Q5TGS1 186 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 NAGSQ8N159 534 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 NXPE1Q8N323 547 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ARL14Q8N4G2 192 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SLCO2A1Q92959 643 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 COPS8Q99627 209 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 KCNK6Q9Y257 313 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.38■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 GPR39O43194 453 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TCEA3O75764 348 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CA5AP35218 305 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 IYDQ6PHW0 289 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 AVL9Q8NBF6 648 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 MCUQ8NE86 351 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.37■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 PTPRBP23467 1997 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CCDC188H7C350 402 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CCL22O00626 93 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 MLNP12872 115 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 F3P13726 295 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 GPR3P46089 330 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ACVR1Q04771 509 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 AMZ2Q86W34 360 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SFRP1Q8N474 314 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CPT1BQ92523 772 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SGSM3Q96HU1 749 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TTC1Q99614 292 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.36■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 A0A0G2JNG1 304 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SNX2O60749 519 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 IDSP22304 550 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ACRV1P26436 265 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 FASLGP48023 281 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CTSCP53634 463 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 DMPKQ09013 629 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 KIR2DS5Q14953 304 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 PCGF5Q86SE9 256 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 HDAC10Q969S8 669 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 SGF29Q96ES7 293 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.35■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.34■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 MAGEB16A2A368 324 aa20.34■□□□□ 0.85
DDR1-255ENST00000504927 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms