RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NOD2Q9HC29 1040 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FAM155BO75949 473 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IDSP22304 550 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ATP11AP98196 1134 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AMZ1Q400G9 498 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NPWQ8N729 165 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GLYATL1Q969I3 302 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 POMT2Q9UKY4 750 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS16A8MUM7 142 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM63AO94886 807 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FURINP09958 794 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF28P17035 718 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SSTR2P30874 369 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ARL4AP40617 200 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 USP8P40818 1118 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 EMC1Q8N766 993 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GPT2Q8TD30 523 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 VPS16Q9H269 839 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NENFQ9UMX5 172 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PQJ5 194 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TEX33O43247 280 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RNF8O76064 485 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0754O94854 1291 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 VIPP01282 170 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC19A1P41440 591 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 BIRC2Q13490 618 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 QPCTQ16769 361 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZVL8 140 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB2Q8N680 514 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OR6C1Q96RD1 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GPR83Q9NYM4 423 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TCFL5Q9UL49 500 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.23e-7■■■■□ 19.9
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA7AO75326 666 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 HALP42357 657 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GABRA4P48169 554 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RELAQ04206 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NAA25Q14CX7 972 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 METRNLQ641Q3 311 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDE4D-210ENST00000503258 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 DLG3Q92796 817 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TCTN2Q96GX1 697 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PEBP4Q96S96 227 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PHF2O75151 1096 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MMP2P08253 660 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OGDHQ02218 1023 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TUBB3Q13509 450 aa7.55□□□□□ -1.2
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