RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	RAB6C	Q53S08	254 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SCML4	Q8N228	414 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BRF2	Q9HAW0	419 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ASAH2	Q9NR71	780 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MPP6	Q9NZW5	540 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	DCX	O43602	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MOCS3	O95396	460 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LIPF	P07098	398 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CNTF	P26441	200 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HOXC9	P31274	260 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CPOX	P36551	454 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	AMER3	Q8N944	861 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KCND2	Q9NZV8	630 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ABI3	Q9P2A4	366 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	COPG2	Q9UBF2	871 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.16	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.15	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TCEA3	O75764	348 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	LIF	P15018	202 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NR2F2	P24468	414 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SP3	Q02447	781 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PPARD	Q03181	441 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GSTA3	Q16772	222 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PACS1	Q6VY07	963 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GTF3C6	Q969F1	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GJD2	Q9UKL4	321 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SARDH	Q9UL12	918 aa		3.15	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TNFSF14	O43557	240 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NKX2-2	O95096	273 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CLPTM1	O96005	669 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	POLB	P06746	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PLA2G4B	P0C869	781 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PTP4A2	Q12974	167 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	METTL7B	Q6UX53	244 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RDM1	Q8NG50	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PKP2	Q99959	881 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CLIC4	Q9Y696	253 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	EML2	O95834	649 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	EPHA2	P29317	976 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SHC1	P29353	583 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ABCD1	P33897	745 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	WNT5A	P41221	380 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CD81	P60033	236 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GPR68	Q15743	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HM13	Q8TCT9	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HVCN1	Q96D96	273 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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