RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494526.1

FBXO18-215, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO18, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-215ENST00000494526 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ULBP3Q9BZM4 244 aa12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 NENFQ9UMX5 172 aa12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 HYOU1Q9Y4L1 999 aa12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.86□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 A6NCN8 305 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 LILRA5A6NI73 299 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 KATNA1O75449 491 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 BPIP17213 487 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SLC19A1P41440 591 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 HALP42357 657 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CLCNKAP51800 687 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 GFERP55789 205 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ABHD18Q0P651 414 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SEPT6Q14141 434 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TFDP2Q14188 446 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PPP2R5EQ16537 467 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PDPK2PQ6A1A2 396 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 IRGCQ6NXR0 463 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ESX1Q8N693 406 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 C9orf72Q96LT7 481 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 OR6C1Q96RD1 312 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TRIB3Q96RU7 358 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 DNAJC7Q99615 494 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CHP1Q99653 195 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 FAM153AQ9UHL3 310 aa12.85□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 OR52A4PA6NMU1 304 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ZNF487B1APH4 448 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 AURKAO14965 403 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CHUKO15111 745 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CST8O60676 142 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PTMSP20962 102 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SLC1A1P43005 524 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 NR2C2P49116 596 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ARL4DP49703 201 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 DCDC1P59894 354 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TLE1Q04724 770 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CDC20Q12834 499 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 LRRC38Q5VT99 294 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CACHD1Q5VU97 1274 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 MFSD7Q6UXD7 560 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PID1Q7Z2X4 250 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 BRSK1Q8TDC3 778 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 STARD8Q92502 1023 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ZDHHC12Q96GR4 267 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TEKT5Q96M29 485 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 TIMM29Q9BSF4 260 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ABHD10Q9NUJ1 306 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.84□□□□□ -0.35
FBXO18-215ENST00000494526 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 UGT1A9O60656 530 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 KIAA0754O94854 1291 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 UGT1A6P19224 532 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 NFKB1P19838 968 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 COMTP21964 271 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 UGT1A1P22309 533 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 UGT1A4P22310 534 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 PTPN3P26045 913 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 DLSTP36957 453 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 WNT3AP56704 352 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 SH3BP2P78314 561 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 CCDC181Q5TID7 509 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 VSIG1Q86XK7 387 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 TTC30BQ8N4P2 665 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 P3H4Q92791 437 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 COL26A1Q96A83 441 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 HAUS1Q96CS2 278 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 OLFM3Q96PB7 478 aa12.83□□□□□ -0.36
FBXO18-215ENST00000494526 SPRY4Q9C004 299 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms