RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490127.5

RBM3-209, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-209	ENST00000490127	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	MAST4	O15021	2626 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	AURKA	O14965	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ANXA9	O76027	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ASMTL	O95671	621 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	BPI	P17213	487 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ACTR1B	P42025	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CHRNA4	P43681	627 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GPR3	P46089	330 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GEM	P55040	296 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ACTR1A	P61163	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CTBS	Q01459	385 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PEX6	Q13608	980 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	LRP8	Q14114	963 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	NKD1	Q969G9	470 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	HACD3	Q9P035	362 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	DNAJC6	O75061	913 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ECEL1	O95672	775 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCDC175	P0C221	793 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PSMB4	P28070	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CD1C	P29017	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	HMGCL	P35914	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	LIMK2	P53671	638 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	TLE1	Q04724	770 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62	4e-7	■■□□□ 13.2
RBM3-209	ENST00000490127	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	NR1D2	Q14995	579 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CARD9	Q9H257	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	NRDC	O43847	1150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SPAM1	P38567	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCR10	P46092	362 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCZ1B	P86790	482 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ART4	Q93070	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-209	ENST00000490127	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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