RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 NAT14Q8WUY8 206 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 VPS35Q96QK1 796 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PP55 124 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PRKAA2P54646 552 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA21Q7Z572 469 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TMPRSS6Q8IU80 811 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DDHD1Q8NEL9 900 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 GANCQ8TET4 914 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 INPP5DQ92835 1189 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SGF29Q96ES7 293 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 THAP1Q9NVV9 213 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SNNO75324 88 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DNTTP04053 509 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 OR56A5P0C7T3 313 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 IL9P15248 144 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ITGB6P18564 788 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ASPHQ12797 758 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LDLRAP1Q5SW96 308 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LIPMQ5VYY2 423 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CES4AQ5XG92 561 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 GLYATL1Q969I3 302 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PTERQ96BW5 349 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 C7orf26Q96N11 449 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PANX3Q96QZ0 392 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DLX3O60479 287 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 MSH3P20585 1137 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TAS2R38P59533 333 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN26Q16670 478 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 EOGTQ5NDL2 527 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CGB2Q6NT52 195 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CPNE9Q8IYJ1 553 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC197Q8NCU1 140 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC126Q96EE4 140 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LINGO1Q96FE5 620 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL12Q9NXK8 326 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SERGEFQ9UGK8 458 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ERICH4A6NGS2 130 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SHISA7A6NL88 538 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 F8W8V4 182 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 MAN2B1O00754 1011 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PCDH8O95206 1070 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 COL9A1P20849 921 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CD72P21854 359 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 OCRLQ01968 901 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CCINQ13939 588 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 RHEBL1Q8TAI7 183 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SLC1A6P48664 564 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TFF2Q03403 129 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DPTQ07507 201 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ANKS4BQ8N8V4 417 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 OR6Y1Q8NGX8 325 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA1191Q96A73 305 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 KCTD5Q9NXV2 234 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SCML1Q9UN30 329 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 MAGEC1O60732 1142 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 MTX2O75431 263 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN12O95859 305 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 RGS4P49798 205 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 OVGP1Q12889 678 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DET1Q7L5Y6 550 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP8Q86W28 1048 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB2Q8N680 514 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 STAG3L4Q8TBR4 150 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 LRRK1Q38SD2 2015 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 OR4D1Q15615 310 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 RAET1GQ6H3X3 334 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CRLF3Q8IUI8 442 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SLC6A17Q9H1V8 727 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CD248Q9HCU0 757 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 IGLON5A6NGN9 336 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM114B3SHH9 223 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 BTN3A1O00481 513 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 INPP4BO15327 924 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TM7SF2O76062 418 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 AP2A2O94973 939 aa26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms