RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF333Q96JL9 665 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT23Q9C075 422 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SYBUQ9NX95 663 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP39A1Q9NYL5 469 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 POLLQ9UGP5 575 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 STX8Q9UNK0 236 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ACEP12821 1306 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PLOD2O00469 737 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP6CO00743 305 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PLPP2O43688 288 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HMMRO75330 724 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DDHD2O94830 711 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MYZAPP0CAP1 466 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MAOAP21397 527 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF8P32971 234 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ADRA1BP35368 520 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIK2Q13002 908 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPAQ15257 358 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 UGCGQ16739 394 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM219AQ8IW50 185 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP76Q8TAP6 659 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MUS81Q96NY9 551 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RUFY1Q96T51 708 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPY26PQ9H489 355 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TBK1Q9UHD2 729 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM22K7EJ46 135 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN4O14493 209 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS4O43181 175 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 UGDHO60701 494 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SOCS5O75159 536 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 REC8O95072 547 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGB8P26012 769 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRA5P31644 462 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNB1P35222 781 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CASP9P55211 416 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PTENP60484 403 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NEDD9Q14511 834 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MEP1AQ16819 746 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CDO1Q16878 200 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OGFOD2Q6N063 350 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PALM2Q8IXS6 379 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RBFAQ8N0V3 343 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BBS10Q8TAM1 723 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF398Q8TD17 642 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM18Q96B42 140 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SPDL1Q96EA4 605 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPHS2Q99611 448 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TARM1B6A8C7 271 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 F8W810 466 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGESO14684 152 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AKAP3O75969 853 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DANCRP0C864 163 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EPORP19235 508 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MYF6P23409 242 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CD27P26842 260 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT5AP41221 380 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HTD2P86397 168 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms