RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF626Q68DY1 528 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf88Q6PI97 169 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GLRX5Q86SX6 157 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 EMC1Q8N766 993 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A28Q96A46 364 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GFI1Q99684 422 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FZD10Q9ULW2 581 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 BECN2A8MW95 431 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD28O15084 1053 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC7A4O43246 635 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RGS14O43566 566 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF217O75362 1048 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TGDSO95455 350 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CH25HO95992 272 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 DNASE1P24855 282 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HRH2P25021 359 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5DP30049 168 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PCGF2P35227 344 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RFX2P48378 723 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 AMZ1Q400G9 498 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MTX3Q5HYI7 312 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 IQUBQ8NA54 791 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RND1Q92730 232 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNDC15Q96J42 360 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MS4A10Q96PG2 267 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA3CQ99985 751 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD6Q9BV23 337 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 EQTNQ9NQ60 294 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SOCS6O14544 535 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC16A5O15375 505 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CELF2O95319 508 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ACHEP22303 614 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MCCP23508 829 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 AMTP48728 403 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCNKAP51800 687 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN20P56880 219 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PPATQ06203 517 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE2BQ13066 116 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GPS2Q13227 327 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPRCAPQ14761 206 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NR1D2Q14995 579 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE2EQ4V326 116 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 C18orf63Q68DL7 685 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT39Q6A163 491 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF534Q76KX8 674 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ADCK2Q7Z695 626 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR180Q86V85 440 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms