RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y8X5 98 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP8B1O43520 1251 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1I1O60431 355 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MTX2O75431 263 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FTH1P02794 183 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGA2BP08514 1039 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTM1P09488 218 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 THEGLP0DJG4 465 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MAOBP27338 520 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRB3P28472 473 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FMO4P31512 558 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CA5AP35218 305 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXD12P35452 270 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LIMK2P53671 638 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A2P55011 1212 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 B4GALNT1Q00973 533 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 POU4F1Q01851 419 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTM4Q03013 218 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC3Q13217 504 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT71Q3SY84 523 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CNSTQ6PJW8 725 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MACC1Q6ZN28 852 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPATCH11Q8N954 259 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR13H1Q8NG92 308 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LOXL4Q96JB6 756 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS39Q96JC1 886 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZIM3Q96PE6 472 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PANX3Q96QZ0 392 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 BOCQ9BWV1 1114 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LGR4Q9BXB1 951 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RY12Q9H244 342 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB23Q9ULC3 237 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR34Q9UPC5 381 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 VWA7Q9Y334 891 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PR77 199 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM23A6NLE4 172 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 E5RI56 91 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TLR4O00206 839 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP2K7O14733 419 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CHUKO15111 745 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KPNA5O15131 536 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 VILLO15195 856 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KMOO15229 486 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GRID2O43424 1007 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 NUAK1O60285 661 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNJ13O60928 360 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS26AO75436 327 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM155BO75949 473 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MYZAPP0CAP1 466 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRM3P20309 590 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CD9P21926 228 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPKAP23677 461 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GCAP28676 217 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5DP30049 168 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO1A2P46721 670 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PRLHRP49683 370 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 BLKP51451 505 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 C21orf59P57076 290 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF844Q08AG5 666 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL7AQ4VC05 210 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MROH9Q5TGP6 573 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DOK6Q6PKX4 331 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DET1Q7L5Y6 550 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM74Q86UV6 250 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms