RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 SGK2Q9HBY8 427 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C9IYK1 514 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GLUD1P00367 558 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GJA9P57773 515 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NR1D2Q14995 579 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FBXL22Q6P050 247 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 Q9Y3F1 56 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NUP98P52948 1817 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 A8MT66 165 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PIRO00625 290 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ASNA1O43681 348 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NR2F1P10589 423 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CYP4B1P13584 511 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CAPZA2P47755 286 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 OLIG2Q13516 323 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 Q96MT0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DEFB118Q96PH6 123 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C1orf21Q9H246 121 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 A0A0U1RQF3 1178 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FKTNO75072 461 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 STBD1O95210 358 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 IVDP26440 423 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MBLAC2Q68D91 279 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NAT16Q8N8M0 369 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MYH11P35749 1972 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 THRBP10828 461 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GSTM5P46439 218 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 THOP1P52888 689 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF33AQ06730 810 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CEP78Q5JTW2 689 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NAT14Q8WUY8 206 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF599Q96NL3 588 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RFPL1O75677 317 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SERPINI2O75830 405 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TULP3O75386 442 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CDK14O94921 469 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CDC73Q6P1J9 531 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ETAA1Q9NY74 926 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PSAT1Q9Y617 370 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PCLAFQ15004 111 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CPQQ9Y646 472 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 H3BM21 787 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 EDNRBP24530 442 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ASMTP46597 345 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CLDN10P78369 228 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NAE1Q13564 534 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GRB14Q14449 540 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 COL26A1Q96A83 441 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms