RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433972.1

RPUSD3-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 1,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-208ENST00000433972 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 A6NCN8 305 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KMOO15229 486 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SUV39H1O43463 412 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 VEGFDO43915 354 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 VCLP18206 1134 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ITGB6P18564 788 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CTNNA2P26232 953 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CDKN2BP42772 138 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 MAPK9P45984 424 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ARSDP51689 593 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 DYNLT1P63172 113 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CYP4F2P78329 520 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GALNT3Q14435 633 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 INSCQ1MX18 579 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KAZNQ674X7 775 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PLD5Q8N7P1 536 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GLYATL1Q969I3 302 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 IL17BQ9UHF5 180 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.69□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 A8MU76 341 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CST8O60676 142 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 EML2O95834 649 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 VIPP01282 170 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 MMP2P08253 660 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CDK18Q07002 472 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KCNAB2Q13303 367 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 MAP7Q14244 749 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 IHHQ14623 411 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GSE1Q14687 1217 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PPP2R5EQ16537 467 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ESX1Q8N693 406 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 P3H4Q92791 437 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PMEPA1Q969W9 287 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 AGAP3Q96P47 875 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 OR2AG1Q9H205 316 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KLC4Q9NSK0 619 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 POT1Q9NUX5 634 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CHUKO15111 745 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 STK17BO94768 372 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 AMD1P17707 334 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 POLE2P56282 527 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZBTB17Q13105 803 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GTF2H3Q13889 308 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SEPT6Q14141 434 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TAZQ16635 292 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ALS2CLQ60I27 953 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 CNTD1Q8N815 330 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KRT35Q92764 455 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TRIB3Q96RU7 358 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TRABDQ9H4I3 376 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 KLHL3Q9UH77 587 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZNF711Q9Y462 761 aa14.67□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.66□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.66□□□□□ -0.06
RPUSD3-208ENST00000433972 ZSCAN12O43309 604 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms