RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PCSK4Q6UW60 755 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NPNTQ6UXI9 565 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PIP4P1Q86T03 277 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PDIK1LQ8N165 341 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FBXW5Q969U6 566 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TLCD1Q96CP7 247 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HDAC11Q96DB2 347 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LRRC39Q96DD0 335 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SPATA13Q96N96 652 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB12Q96P63 405 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HAPLN3Q96S86 360 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VAT1Q99536 393 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CLMPQ9H6B4 373 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 WDCPQ9H6R7 721 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 BRD9Q9H8M2 597 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GALNT8Q9NY28 637 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DONSONQ9NYP3 566 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CBLCQ9ULV8 474 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MAFFQ9ULX9 164 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NEU3Q9UQ49 428 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 THADAQ6YHU6 1953 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ITPR3Q14573 2671 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RASGRF2O14827 1237 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CREB3O43889 395 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CDH16O75309 829 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ACSL3O95573 720 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MPIG6BO95866 241 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MLNP12872 115 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CEBPBP17676 345 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 YWHAQP27348 245 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RBL1P28749 1068 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA4P43358 317 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TUBP50607 506 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 COG7P83436 770 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CDK16Q00536 496 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PLD1Q13393 1074 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC29A2Q14542 456 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCDC38Q502W7 563 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.355e-9■□□□□ 10.9
CCL20-202ENST00000409189 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SCD5Q86SK9 330 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CEP57Q86XR8 500 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TDRPQ86YL5 185 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZNF276Q8N554 614 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 AMER2Q8N7J2 671 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MCUQ8NE86 351 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FBXO32Q969P5 355 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARL8AQ96BM9 186 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCDC77Q9BR77 488 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 USP29Q9HBJ7 922 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 COX16Q9P0S2 106 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SENP1Q9P0U3 644 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DPP7Q9UHL4 492 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CREBBPQ92793 2442 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms