RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 ITM2AO43736 263 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DLX3O60479 287 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DCTN3O75935 186 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0754O94854 1291 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CSPG5O95196 566 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PIGNO95427 931 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RBP1P09455 135 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MYL2P10916 166 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ADH5P11766 374 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 EPHA1P21709 976 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINA4P29622 427 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MC4RP32245 332 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BMP8BP34820 402 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HNF1BP35680 557 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINB5P36952 375 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PTGER3P43115 390 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SLC1A6P48664 564 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TTPAP49638 278 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HK2P52789 917 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NFKB2Q00653 900 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CACNG1Q06432 222 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ITGA9Q13797 1035 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF460Q14592 562 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ACAP2Q15057 778 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PDGFRLQ15198 375 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GEN1Q17RS7 908 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LIPMQ5VYY2 423 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CERS6Q6ZMG9 384 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RAPH1Q70E73 1250 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZAR1Q86SH2 424 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ISCA2Q86U28 154 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 STK40Q8N2I9 435 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 OTUD6BQ8N6M0 293 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GPATCH11Q8N954 259 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TTC8Q8TAM2 541 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ING5Q8WYH8 240 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FGF13Q92913 245 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SKA1Q96BD8 255 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SCRN2Q96FV2 425 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NDNQ99608 321 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DRC3Q9H069 523 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 P2RY12Q9H244 342 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PIDD1Q9HB75 910 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NPHS2Q9NP85 383 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SAR1AQ9NR31 198 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 XPR1Q9UBH6 696 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DKK3Q9UBP4 350 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MSRAQ9UJ68 235 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM24O15164 1050 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PFDN6O15212 129 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NPHS1O60500 1241 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.451e-323■□□□□ 8.8
C6orf48-208ENST00000395788 UBOX5O94941 541 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NFATC1O95644 943 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN15O95858 294 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN12O95859 305 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ESR1P03372 595 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ALPIP09923 528 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS56P0CW18 603 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC166P0CW27 439 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms