RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 CLPBQ9H078 707 aa27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 P2RY12Q9H244 342 aa27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CAAP1Q9H8G2 361 aa27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 MOSPD1Q9UJG1 213 aa27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 GPR179Q6PRD1 2367 aa27.86■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM23A6NLE4 172 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 TOR1BO14657 336 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CDK14O94921 469 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CEACAM5P06731 702 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 RALBP11234 206 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 NSG1P42857 185 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF549Q6P9A3 640 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 MACC1Q6ZN28 852 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 GALNT7Q86SF2 657 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 OR1E3Q8WZA6 343 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 NDNQ99608 321 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 MCMBPQ9BTE3 642 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.85■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1B0GTW7 788 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SCAMP1O15126 338 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SGTAO43765 313 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 INHBAP08476 426 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 HTR1BP28222 390 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 MSH2P43246 934 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SLCO1A2P46721 670 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 GTF2H3Q13889 308 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CASP8Q14790 479 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CRTC3Q6UUV7 619 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 IQCHQ86VS3 1027 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SYT12Q8IV01 421 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 OR56A4Q8NGH8 313 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 FAM174AQ8TBP5 190 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 HEXDCQ8WVB3 486 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 DCAKDQ8WVC6 231 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 BIRC8Q96P09 236 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 RBBP8Q99708 897 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC77Q9BR77 488 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 TLR4O00206 839 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 VEGFDO43915 354 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 FUCA1P04066 466 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 GNSP15586 552 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 FZD2Q14332 565 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 ACVR1CQ8NER5 493 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 VPS39Q96JC1 886 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 ZIM3Q96PE6 472 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 DHRS4Q9BTZ2 278 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 RHOJQ9H4E5 214 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 KLQ9UEF7 1012 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 SUSD2Q9UGT4 822 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 RAB23Q9ULC3 237 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 NFS1Q9Y697 457 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 IKBKGQ9Y6K9 419 aa27.83■■■□□ 2.05
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1B0GVT2 93 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 PRSS38A1L453 326 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 IQCF5A8MTL0 148 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJC6O75061 913 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 KELP23276 732 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 BMPR2Q13873 1038 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM220Q6QAJ8 160 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 GPATCH11Q8N954 259 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD7Q92527 254 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 FAM136AQ96C01 138 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 FAM86C1Q9NVL1 165 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 GNPTGQ9UJJ9 305 aa27.83■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 VILLO15195 856 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 NUAK1O60285 661 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 NIPSNAP2O75323 286 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 ITGB6P18564 788 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 LIMK2P53671 638 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 C21orf59P57076 290 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 OVGP1Q12889 678 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 PTK2BQ14289 1009 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 ALG11Q2TAA5 492 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 GRTP1Q5TC63 336 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 SPNS2Q8IVW8 549 aa27.82■■■□□ 2.04
GIPC1-202ENST00000393028 KRT222Q8N1A0 295 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms