RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 OR1F2PQ96R84 312 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 PCSK5Q92824 1860 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 NDUFS4O43181 175 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 LINC00271P0C7V0 271 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 C5AR2Q9P296 337 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 WNT16Q9UBV4 365 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 TBX10O75333 385 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TEX38Q6PEX7 206 aa3.05□□□□□ -1.92
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