RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 REV3LO60673 3130 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TTC34A8MYJ7 566 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 UBDO15205 165 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SLC22A2O15244 555 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PSMG1O95456 288 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GNAZP19086 355 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TTC1Q99614 292 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PIDD1Q9HB75 910 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 AZIN1O14977 448 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TGFBIQ15582 683 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ANKS6Q68DC2 871 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 NXPE1Q8N323 547 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ASB2Q96Q27 587 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GIMAP2Q9UG22 337 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 KLK8O60259 260 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ACTR3P61158 418 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GK5Q6ZS86 529 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 HPS6Q86YV9 775 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 HMGCLL1Q8TB92 370 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PIP5K1BO14986 540 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SNX2O60749 519 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 VIPR2P41587 438 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GDPD4Q6W3E5 623 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 AHI1Q8N157 1196 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PCTPQ9UKL6 214 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 BTRCQ9Y297 605 aa23.47■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SCN8AQ9UQD0 1980 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 VGLL3A8MV65 326 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ZNF197O14709 1029 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GPC4O75487 556 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 FGF4P08620 206 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 DHCR24Q15392 516 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 KANK2Q63ZY3 851 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 DDIASQ8IXT1 998 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 DSELQ8IZU8 1212 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 ZNF366Q8N895 744 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 C19orf43Q9BQ61 176 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TUBB1Q9H4B7 451 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 CD84Q9UIB8 345 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 STX16O14662 325 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TBX10O75333 385 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 RB1P06400 928 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 DMC1Q14565 340 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 CCDC6Q16204 474 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 GPR33Q49SQ1 333 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 KYQ8NBH2 561 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 FRS2Q8WU20 508 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 AKTIPQ9H8T0 292 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 MARK1Q9P0L2 795 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 TIMM22Q9Y584 194 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 SZT2Q5T011 3432 aa23.45■■□□□ 1.35
LHX3-201ENST00000371746 C1SP09871 688 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 GPM6BQ13491 265 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 SBSNQ6UWP8 590 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 FRA10AC1Q70Z53 315 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 KIRREL3Q8IZU9 778 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 OTUB2Q96DC9 234 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 NPAS2Q99743 824 aa23.45■■□□□ 1.34
LHX3-201ENST00000371746 ZNF225Q9UK10 706 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms