RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 VNN1O95497 513 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ITGAXP20702 1163 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CTSKP43235 329 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R39P59534 338 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf80Q0P641 193 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MED22Q15528 200 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 AP3S1Q92572 193 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 AGRPO00253 132 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 VIPP01282 170 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 IFNGP01579 166 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MYL9P24844 172 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PRDX6P30041 224 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HAPLN3Q96S86 360 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HAT1O14929 419 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SCNN1AP37088 669 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LAPTM5Q13571 262 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL12Q53G59 568 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF384Q8TF68 577 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 S100ZQ8WXG8 99 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CIB1Q99828 191 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OR2AG2A6NM03 316 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B11O75310 529 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN2P17706 415 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CAPGP40121 348 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DDI2Q5TDH0 399 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GULP1Q9UBP9 304 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 IRGMA1A4Y4 181 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PNLIPRP1P54315 467 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 WWP2O00308 870 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA1P01009 418 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4B1P13584 511 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LIPEQ05469 1076 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CHIT1Q13231 466 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MED27Q6P2C8 311 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 POC5Q8NA72 575 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN8A6NHC0 703 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PRPS2P11908 318 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 UGT1A5P35504 534 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD8P48556 350 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HNMTP50135 292 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF132P52740 706 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LPCAT4Q643R3 524 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MPP5Q8N3R9 675 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ACSS2Q9NR19 701 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 IQCF5A8MTL0 148 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FPGTO14772 594 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NPHS1O60500 1241 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A3P40879 764 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 IRAK2O43187 625 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF21O75509 655 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NSG1P42857 185 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 8.9
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2H2Q13888 395 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms