RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 LAMA4Q16363 1823 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 MYH1P12882 1939 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 MYH4Q9Y623 1939 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 H7C4K7 107 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 CCRL2O00421 344 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 ARPC2O15144 300 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 OR4Q2P0C623 313 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 MYL12AP19105 171 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 GNPDA1P46926 289 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF132P52740 706 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 ECT2LQ008S8 904 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 PRKCQQ04759 706 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 FAR1Q8WVX9 515 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 TLE6Q9H808 572 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 GIN1Q9NXP7 522 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 A0A1B0GVG6 124 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 E9PAM4 449 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 SLC28A1O00337 649 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 TMCC2O75069 709 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 TSPAN19P0C672 248 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 CES1P23141 567 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 SLC26A3P40879 764 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 GATA6Q92908 595 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-202ENST00000353284 A0A1W2PQ72 361 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 FAM189A1O60320 539 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CCNKO75909 580 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 C22orf31O95567 290 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PDPRQ8NCN5 879 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 LRRC58Q96CX6 371 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SNX27Q96L92 541 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 A0A1W2PQH9 124 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 NDUFS2O75306 463 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 EGFRP00533 1210 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TFPTP0C1Z6 253 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 GRK3P35626 688 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TRIM32Q13049 653 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 25.3
PTPRS-202ENST00000353284 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 DET1Q7L5Y6 550 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 MON1AQ86VX9 555 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 GPR156Q8NFN8 814 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PPTC7Q8NI37 304 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 FBXL20Q96IG2 436 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 APOLD1Q96LR9 279 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 IPPKQ9H8X2 491 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SLC7A4O43246 635 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 RFX3P48380 749 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CXCR3P49682 368 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 LGALS3BPQ08380 585 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ANKRD46Q86W74 232 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ITCHQ96J02 903 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CNTN3Q9P232 1028 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 UROSP10746 265 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 WEE1P30291 646 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 HSPA7P48741 367 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 GSK3BP49841 420 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 KRT74Q7RTS7 529 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 DENND1CQ8IV53 801 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TRPV3Q8NET8 790 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TEX28O15482 410 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TULP3O75386 442 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms