RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf64Q86WR6 236 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HACD1B0YJ81 288 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ANHXE9PGG2 379 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PLD2O14939 933 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGA8P53708 1063 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ASPHQ12797 758 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MPP3Q13368 585 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SERINC3Q13530 473 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA6Q15825 494 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RAB43Q86YS6 212 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MDM1Q8TC05 714 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TBATAQ96M53 351 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 XKR8Q9H6D3 395 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LDAHQ9H6V9 325 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SYTL2Q9HCH5 934 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 DGKAP23743 735 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 YPEL5P62699 121 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MXRA7P84157 204 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CTBSQ01459 385 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IRF8Q02556 426 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf54Q08AI8 447 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SCAPQ12770 1279 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CSHL1Q14406 222 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf22Q6V702 233 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PHC3Q8NDX5 983 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf74Q96LT6 269 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM107BQ9H098 131 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCND3Q9UK17 655 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 TECTAO75443 2155 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 POLEQ07864 2286 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A0MRY4 1105 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LNP1A1A4G5 178 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 VEGFDO43915 354 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF11O60813 436 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM1P13688 526 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MGAT1P26572 445 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD12P35452 270 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AVPR1BP47901 424 aa4.39□□□□□ -1.71
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