RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342785.8

VCAN-202, Transcript of versican, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VCAN, Length 7,154 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAN-202ENST00000342785 ERVK-8P63133 956 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 PARP8Q8N3A8 854 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 ZBTB2Q8N680 514 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 BRD9Q9H8M2 597 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 ALOX12P18054 663 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 NADK2Q4G0N4 442 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SDE2Q6IQ49 451 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 C14orf80Q86SX3 495 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 MTERF3Q96E29 417 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 A0A088AWK7 358 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 CDC7O00311 574 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 TRIM24O15164 1050 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SUV39H1O43463 412 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SGTAO43765 313 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SCELO95171 688 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 SDHDO14521 159 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 CDK14O94921 469 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 SLC26A3P40879 764 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 XYLBO75191 536 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.12□□□□□ -1.27
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VCAN-202ENST00000342785 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 GCAP28676 217 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 UGT1A3P35503 534 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 UGT1A5P35504 534 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VCAN-202ENST00000342785 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.12□□□□□ -1.27
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