RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 F2P00734 622 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 HTR1EP28566 365 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ADAM17P78536 824 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 EMX2Q04743 252 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 NKG7Q16617 165 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 PERM1Q5SV97 790 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 HTR1BP28222 390 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 MFSD10Q14728 455 aa25.06■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa25.06■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 RAB2BQ8WUD1 216 aa25.06■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RAD21L1Q9H4I0 556 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 GMIPQ9P107 970 aa25.06■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 FMO4P31512 558 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RENBPP51606 427 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 THAP5Q7Z6K1 395 aa25.05■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 GPC2Q8N158 579 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 MUC13Q9H3R2 512 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SP110Q9HB58 689 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 PLXNB2O15031 1838 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 MUSKO15146 869 aa25.05■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 XKR7Q5GH72 579 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ENPP6Q6UWR7 440 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SMIM14Q96QK8 99 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 MBOAT4Q96T53 435 aa25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 KRBA1A5PL33 1030 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 F8W810 466 aa25.04■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 MTHFRP42898 656 aa25.04■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 ANKS6Q68DC2 871 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 FAM171BQ6P995 826 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 DLEU7Q6UYE1 221 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SNX2O60749 519 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 INMTO95050 263 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RAD23AP54725 363 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TAMM41Q96BW9 452 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ABHD8Q96I13 439 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 LRRC3Q9BY71 257 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TRIM17Q9Y577 477 aa25.04■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PQH9 124 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 KERAO60938 352 aa25.03■■□□□ 1.6
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SENP3-201ENST00000321337 CRTC3Q6UUV7 619 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1191Q96A73 305 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 PCDH12Q9NPG4 1184 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RHOBTB1O94844 696 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 FSHRP23945 695 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 GSTM2P28161 218 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 IFITM3Q01628 133 aa25.03■■□□□ 1.6
SENP3-201ENST00000321337 RBBP7Q16576 425 aa25.03■■□□□ 1.6
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