RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 BTBD2Q9BX70 525 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 BEX2Q9BXY8 128 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CLPBQ9H078 707 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 NUAK2Q9H093 628 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 OPTCQ9UBM4 332 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SNX6Q9UNH7 406 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 USP3Q9Y6I4 520 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1W2PP18 115 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1W2PQ72 361 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF487B1APH4 448 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 GSTA4O15217 222 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CNTN5O94779 1100 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 KRT6AP02538 564 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MT-ND2P03891 347 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 KRT6BP04259 564 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ATICP31939 592 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 HTR2BP41595 481 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ACADSBP45954 432 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CSRP3P50461 194 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 UFM1P61960 85 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 GPLD1P80108 840 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PPP2R2BQ00005 443 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 GHRHRQ02643 423 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 RAPSNQ13702 412 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 DACT2Q5SW24 774 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 DEFB106AQ8N104 65 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 OR8H2Q8N162 312 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 IPMKQ8NFU5 416 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 YIPF6Q96EC8 236 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MAP6Q96JE9 813 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MMP27Q9H306 513 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 RNF146Q9NTX7 359 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SCN3BQ9NY72 215 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 EHD3Q9NZN3 535 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 C3orf18Q9UK00 162 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 FZD10Q9ULW2 581 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ABCA3Q99758 1704 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SCN4AP35499 1836 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CDK2AP1O14519 115 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 BCKDKO14874 412 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 HAT1O14929 419 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MED26O95402 600 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 C1RP00736 705 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LCKP06239 509 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 RBP1P09455 135 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 IFI30P13284 250 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ERCC2P18074 760 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 IMPDH1P20839 514 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CD6P30203 668 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CYP2C18P33260 490 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 NOS2P35228 1153 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SNX16P57768 344 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 TUBA1BP68363 451 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 LAPTM4AQ15012 233 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ACOX1Q15067 660 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CRY1Q16526 586 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 BCL7AQ4VC05 210 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN3-201ENST00000308478 TUBA1AQ71U36 451 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms