RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 CCL14Q16627 93 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 NMBRP28336 390 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GPR33Q49SQ1 333 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 DEF8Q6ZN54 512 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GTF2H2Q13888 395 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.97■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ITGAXP20702 1163 aa22.96■■□□□ 1.27
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TARBP1-201ENST00000040877 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 AGAP2Q99490 1192 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 NPAS2Q99743 824 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 MTRRQ9UBK8 725 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GULP1Q9UBP9 304 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 TAS2R41P59536 307 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GJD3Q8N144 294 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 INSL6Q9Y581 213 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ADGRF1Q5T601 910 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 BTBD9Q96Q07 612 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ILVBLA1L0T0 632 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 UGT2B17O75795 530 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 PCCBP05166 539 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF516Q92618 1163 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ALOX12P18054 663 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 WASP42768 502 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF132P52740 706 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.96■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 PEAK1Q9H792 1746 aa22.95■■□□□ 1.27
TARBP1-201ENST00000040877 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 CLDN4O14493 209 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 NR2F6P10588 404 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 HSPA7P48741 367 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 YIPF1Q9Y548 306 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 UGT1A5P35504 534 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 PPM1JQ5JR12 505 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 IL23RQ5VWK5 629 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 RINLQ6ZS11 566 aa22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.95■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 C2orf80Q0P641 193 aa22.95■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa22.94■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 CARD16Q5EG05 197 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 BCO2Q9BYV7 579 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 CYP4F2P78329 520 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.94■■□□□ 1.26
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