RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	WFS1	O76024	890 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	FSHR	P23945	695 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QL48	77 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	SKI	P12755	728 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB15	P59190	212 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	NR5A1	Q13285	461 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP9B	O43861	1147 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	NR3C2	P08235	984 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	SMPD1	P17405	629 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	NNT	Q13423	1086 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEC	B2RU33	542 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.52	□□□□□ -1.2
EFHC1-223	ENST00000636616	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOA4	Q13772	614 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	HPS1	Q92902	700 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	EML3	Q32P44	896 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG7	O95352	703 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	USP4	Q13107	963 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	LILRA1	O75019	489 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	SCTR	P47872	440 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMP2	P16035	220 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	DGAT1	O75907	488 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	AVP	P01185	164 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	CBLB	Q13191	982 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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