RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC24A1O60721 1099 aa22.73■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAP3K5Q99683 1374 aa22.73■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MSH5O43196 834 aa22.72■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.71■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.71■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NBPF6Q5VWK0 638 aa22.7■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NBPF4Q96M43 638 aa22.7■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MEGF6O75095 1541 aa22.69■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UTRNP46939 3433 aa22.69■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NSD2O96028 1365 aa22.68■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.68■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.68■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP47Q96K76 1375 aa22.67■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FYB1O15117 783 aa22.67■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RTL1A6NKG5 1358 aa22.66■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMF1P82094 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RGPD2P0DJD1 1756 aa22.66■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TATP17735 454 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.65■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CGNL1Q0VF96 1302 aa22.64■■□□□ 1.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CHD4Q14839 1912 aa22.63■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.63■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.63■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y QSER1Q2KHR3 1735 aa22.62■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1QTNF8P60827 252 aa22.62■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LY75O60449 1722 aa22.61■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MSL1Q68DK7 614 aa22.61■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.61■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.6■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.59■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.58■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.58■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y INSRP06213 1382 aa22.58■■□□□ 1.21
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDCA8Q53HL2 280 aa22.57■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FLT4P35916 1363 aa22.56■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL24A1Q17RW2 1714 aa22.56■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PALLDQ8WX93 1383 aa22.55■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GRIN3BO60391 1043 aa22.54■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP27B1O15528 508 aa22.53■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FLAD1Q8NFF5 587 aa22.53■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.53■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AK7Q96M32 723 aa22.51■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CARD14Q9BXL6 1004 aa22.51■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF24Q5T7B8 1368 aa22.5■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF20BQ96Q89 1820 aa22.5■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C5P01031 1676 aa22.49■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NSD3Q9BZ95 1437 aa22.48■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHF14O94880 888 aa22.48■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPG7Q9UQ90 795 aa22.48■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CD2APQ9Y5K6 639 aa22.48■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PIGBQ92521 554 aa22.47■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SMIM5Q71RC9 77 aa22.46■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AMIGO3Q86WK7 504 aa22.44■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLR3GLQ9BT43 218 aa22.44■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMOD3Q9NYL9 352 aa22.43■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WWC3Q9ULE0 1092 aa22.43■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.42■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EYA1Q99502 592 aa22.42■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C4BP0C0L5 1744 aa22.42■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.42■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.41■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SIK1P57059 783 aa22.41■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.41■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LINC00116Q8NCU8 138 aa22.4■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ITGB4P16144 1822 aa22.4■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATP10DQ9P241 1426 aa22.4■■□□□ 1.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.39■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GNPATO15228 680 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SSFA2P28290 1259 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATP6V1AP38606 617 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLKQ9UBT6 870 aa22.38■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.37■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHKG2P15735 406 aa22.37■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NCAPD2Q15021 1401 aa22.37■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ITPK1Q13572 414 aa22.36■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATG3Q9NT62 314 aa22.33■■□□□ 1.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UBR3Q6ZT12 1888 aa22.32■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MMP10P09238 476 aa22.3■■□□□ 1.16
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