RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621269.4

ATXN3-253, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-253	ENST00000621269	MEGF6	O75095	1541 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ATXN3-253	ENST00000621269	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
ATXN3-253	ENST00000621269	BTAF1	O14981	1849 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ATXN3-253	ENST00000621269	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	PANK3	Q9H999	370 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	NSD2	O96028	1365 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	PTGER2	P43116	358 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ATXN3-253	ENST00000621269	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	KCNQ4	P56696	695 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	EYA1	Q99502	592 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	CYP27B1	O15528	508 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ATXN3-253	ENST00000621269	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	LY75	O60449	1722 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.9	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	ARX	Q96QS3	562 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86	3e-6	■■□□□ 13.5
ATXN3-253	ENST00000621269	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATXN3-253	ENST00000621269	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	POLD1	P28340	1107 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ATXN3-253	ENST00000621269	MSH5	O43196	834 aa		32.81	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	PIGB	Q92521	554 aa		32.81	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	PHKG2	P15735	406 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	YY1	P25490	414 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	ITGB4	P16144	1822 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATXN3-253	ENST00000621269	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	C5	P01031	1676 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	AK7	Q96M32	723 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ATXN3-253	ENST00000621269	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	SIK1	P57059	783 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ATXN3-253	ENST00000621269	IL13	P35225	146 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	PHF14	O94880	888 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ATXN3-253	ENST00000621269	MTHFS	P49914	203 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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