RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-211	ENST00000620030	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP1CC-211	ENST00000620030	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP1CC-211	ENST00000620030	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CC-211	ENST00000620030	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CC-211	ENST00000620030	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CC-211	ENST00000620030	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	BTAF1	O14981	1849 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	EYA1	Q99502	592 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP1CC-211	ENST00000620030	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	NSD2	O96028	1365 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	CYP27B1	O15528	508 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-211	ENST00000620030	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	PTGER2	P43116	358 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	KCNQ4	P56696	695 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76	1e-11	■□□□□ 8.8
PPP1CC-211	ENST00000620030	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-211	ENST00000620030	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP1CC-211	ENST00000620030	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	LY75	O60449	1722 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	PHKG2	P15735	406 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	PIGB	Q92521	554 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-211	ENST00000620030	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	IL13	P35225	146 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-211	ENST00000620030	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	MTHFS	P49914	203 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	ITGB4	P16144	1822 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	ARX	Q96QS3	562 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-211	ENST00000620030	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	KDR	P35968	1356 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	SIK1	P57059	783 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	MSH5	O43196	834 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	POLD1	P28340	1107 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-211	ENST00000620030	MAP3K5	Q99683	1374 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	C5	P01031	1676 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	ITPK1	Q13572	414 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-211	ENST00000620030	AK7	Q96M32	723 aa		31.91	■■■□□ 2.7

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