RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 RREB1Q92766 1687 aa21.97■■□□□ 1.11
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC27Q2M243 656 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.94■■□□□ 1.1
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.83■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-210ENST00000617904 LTN1O94822 1766 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.74■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CASZ1Q86V15 1759 aa21.71■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-210ENST00000617904 IL2RBP14784 551 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 NHSQ6T4R5 1651 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFT57Q9NWB7 429 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC15A2Q16348 729 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 STK32BQ9NY57 414 aa21.64■■□□□ 1.05
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