RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 ABCC11Q96J66 1382 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 HIP1O00291 1037 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 CLCN1P35523 988 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
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PTPRT-210ENST00000617474 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 RAB11FIP3O75154 756 aa18.29■□□□□ 0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.29■□□□□ 0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 ZMYND15Q9H091 742 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 TMX3Q96JJ7 454 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRT-210ENST00000617474 GUCY1B3Q02153 619 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 ERICH4A6NGS2 130 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 TSPYL6Q8N831 410 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 BTBD11A6QL63 1104 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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PTPRT-210ENST00000617474 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.25■□□□□ 0.51
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PTPRT-210ENST00000617474 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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PTPRT-210ENST00000617474 ANXA1P04083 346 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
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PTPRT-210ENST00000617474 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC66A2RUB6 948 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 STX6O43752 255 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 G3V3G9 751 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 CEP89Q96ST8 783 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 GRIN2AQ12879 1464 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.22■□□□□ 0.51
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