RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 NFE2L2Q16236 605 aa27.67■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.67■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 IL2RBP14784 551 aa27.66■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.65■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 BARGINQ6ZT62 677 aa27.64■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.64■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 NEUROD2Q15784 382 aa27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF521Q96K83 1311 aa27.62■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC37A3O60309 1634 aa27.61■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 RIPK4P57078 832 aa27.61■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.6■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 CYP27B1O15528 508 aa27.59■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.59■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 NEFMP07197 916 aa27.58■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC27Q2M243 656 aa27.58■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.57■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.57■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 WWC1Q8IX03 1113 aa27.56■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 SPG7Q9UQ90 795 aa27.56■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 NGEFQ8N5V2 710 aa27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K5Q99683 1374 aa27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 TNS2Q63HR2 1409 aa27.55■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 PHKG2P15735 406 aa27.54■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 DCTN1Q14203 1278 aa27.54■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.53■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.52■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 POTEAQ6S8J7 498 aa27.52■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 IL17REQ8NFR9 667 aa27.52■■■□□ 2
CSAG3-202ENST00000617158 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.51■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 MCM10Q7L590 875 aa27.5■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 LGR6Q9HBX8 967 aa27.5■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 EXOC5O00471 708 aa27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.48■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.48■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 DDB1Q16531 1140 aa27.47■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.47■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.47■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.47■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.46■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
CSAG3-202ENST00000617158 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.45■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 WDR63Q8IWG1 891 aa27.45■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.45■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 MRC1P22897 1456 aa27.41■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF853P0CG23 659 aa27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA2Q08379 1002 aa27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 SLFN5Q08AF3 891 aa27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF5Q96JK2 942 aa27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 IL16Q14005 1332 aa27.4■■□□□ 1.98
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 RXRBP28702 533 aa27.38■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 ITGB4P16144 1822 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0G2JS52 829 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 RGS12O14924 1447 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 MYT1Q01538 1121 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 PDE3BQ13370 1112 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 CHL1O00533 1208 aa27.34■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.34■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 FAM182BQ5T319 152 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 CFAP44Q96MT7 982 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 IFT57Q9NWB7 429 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.33■■□□□ 1.97
CSAG3-202ENST00000617158 E9PSI1 815 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms