RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615024.4

RDM1-217, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 617 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-217ENST00000615024 IGSF3O75054 1194 aa5.88□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 MAP3K9P80192 1104 aa5.88□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.88□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.88□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 PBX2P40425 430 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 RETREG2Q8NC44 543 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 MTMR7Q9Y216 660 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 METP08581 1390 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 PTPRUQ92729 1446 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 CLTCL1P53675 1640 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 KIF1AQ12756 1690 aa5.87□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 MS4A1P11836 297 aa5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 BAG6P46379 1132 aa5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 IRF5Q13568 498 aa5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 POM121Q96HA1 1249 aa5.86□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ARHGEF10O15013 1369 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 TBC1D12O60347 775 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ORAI2Q96SN7 254 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 STK26Q9P289 416 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 PPLO60437 1756 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 LAMC1P11047 1609 aa5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ATRNO75882 1429 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ARHGAP33O14559 1287 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 FOXO3O43524 673 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 POGKQ9P215 609 aa5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RDM1-217ENST00000615024 NAIPQ13075 1403 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 NUTM2FA1L443 756 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 GNPATO15228 680 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 FECHP22830 423 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PTGER2P43116 358 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 RGL3Q3MIN7 710 aa5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 EVI5O60447 810 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PSEN2P49810 448 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 ZNF428Q96B54 188 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 MYOM2P54296 1465 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.82□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 USP32Q8NFA0 1604 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 GRXCR2A6NFK2 248 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 OSBPP22059 807 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 HIC1Q14526 733 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 ABCC11Q96J66 1382 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 ADGRB2O60241 1585 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 IFT172Q9UG01 1749 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 PXDNQ92626 1479 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 HRO43593 1189 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 FOSBP53539 338 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 VPS72Q15906 364 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 NBPF14Q5TI25 921 aa5.8□□□□□ -1.48
RDM1-217ENST00000615024 COG6Q9Y2V7 657 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms