RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
DGCR6-208	ENST00000608842	CHL1	O00533	1208 aa		30.13	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	30.12	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	VAMP4	O75379	141 aa		30.12	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	TSPYL6	Q8N831	410 aa		30.12	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	ERBB3	P21860	1342 aa		30.12	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	CPD	O75976	1380 aa		30.12	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF428	Q96B54	188 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	TNN	Q9UQP3	1299 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	PANK1	Q8TE04	598 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	MAP3K5	Q99683	1374 aa		30.09	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		30.08	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		30.08	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	RLBP1	P12271	317 aa		30.08	■■■□□ 2.41
DGCR6-208	ENST00000608842	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		30.07	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	KIAA0232	Q92628	1395 aa		30.07	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		30.05	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		30.04	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	COG6	Q9Y2V7	657 aa		30.03	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	CHRNA2	Q15822	529 aa		30.01	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.4
DGCR6-208	ENST00000608842	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		30	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	TRIM27	P14373	513 aa		30	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF16B	Q96L93	1317 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	KRT24	Q2M2I5	525 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		29.97	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.97	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.97	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		29.96	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.95	■■■□□ 2.39
DGCR6-208	ENST00000608842	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	MS4A1	P11836	297 aa		29.94	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.94	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.93	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	MEGF6	O75095	1541 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	AAMP	Q13685	434 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		29.89	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.89	■■■□□ 2.38
DGCR6-208	ENST00000608842	CACNA1F	O60840	1977 aa		29.88	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.87	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.85	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.85	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.85	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DGCR6-208	ENST00000608842	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.82	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	PHLPP1	O60346	1717 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	ABCC4	O15439	1325 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	IGHD	P01880	384 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	RGS12	O14924	1447 aa		29.8	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DGCR6-208	ENST00000608842	PHKG2	P15735	406 aa		29.75	■■■□□ 2.35
DGCR6-208	ENST00000608842	TEF	Q10587	303 aa		29.75	■■■□□ 2.35
DGCR6-208	ENST00000608842	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
DGCR6-208	ENST00000608842	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35

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