RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 RTL1A6NKG5 1358 aa25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 MTFR1LQ9H019 292 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 LY75O60449 1722 aa25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 NSD2O96028 1365 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 AKT1S1Q96B36 256 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 CDCA8Q53HL2 280 aa25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-210ENST00000595594 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.7■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 SYT17Q9BSW7 474 aa25.7■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.7■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.7■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 INSRP06213 1382 aa25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 FLT4P35916 1363 aa25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 ARXQ96QS3 562 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 ITGB4P16144 1822 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 KLHL34Q8N239 644 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 UTRNP46939 3433 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 C5P01031 1676 aa25.61■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.61■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 CHD4Q14839 1912 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 CYP27B1O15528 508 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 MSH5O43196 834 aa25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-210ENST00000595594 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 POLD1P28340 1107 aa25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 MSL1Q68DK7 614 aa25.54■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 PALLDQ8WX93 1383 aa25.54■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 MAP3K5Q99683 1374 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 EYA1Q99502 592 aa25.52■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 POLKQ9UBT6 870 aa25.52■■□□□ 1.68
FCHO1-210ENST00000595594 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 NCAPD2Q15021 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 GPR162Q16538 588 aa25.5■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 C4BP0C0L5 1744 aa25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 SMIM5Q71RC9 77 aa25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 PIGBQ92521 554 aa25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 SPG7Q9UQ90 795 aa25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-210ENST00000595594 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 PANK3Q9H999 370 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 PHF14O94880 888 aa25.42■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 AK7Q96M32 723 aa25.41■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 PHKG2P15735 406 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.39■■□□□ 1.66
FCHO1-210ENST00000595594 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.38■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 SIK1P57059 783 aa25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 ITPK1Q13572 414 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 ATG3Q9NT62 314 aa25.33■■□□□ 1.65
FCHO1-210ENST00000595594 ATP6V1AP38606 617 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-210ENST00000595594 MORC1Q86VD1 984 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-210ENST00000595594 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-210ENST00000595594 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-210ENST00000595594 GNPATO15228 680 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms