RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592907.5

USP36-224, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 2

Gene USP36, Length 543 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-224	ENST00000592907	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.79	■■■□□ 2.84
USP36-224	ENST00000592907	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.79	■■■□□ 2.84
USP36-224	ENST00000592907	MYOM1	P52179	1685 aa		32.78	■■■□□ 2.84
USP36-224	ENST00000592907	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
USP36-224	ENST00000592907	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.78	■■■□□ 2.84
USP36-224	ENST00000592907	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.76	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.74	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	NSD2	O96028	1365 aa		32.73	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.73	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.72	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.72	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.72	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.71	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.7	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.7	■■■□□ 2.83
USP36-224	ENST00000592907	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.68	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.68	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.68	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.66	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.66	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.65	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.65	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.64	■■■□□ 2.82
USP36-224	ENST00000592907	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.61	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.6	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	CYP27B1	O15528	508 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	ARX	Q96QS3	562 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.59	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	YY1	P25490	414 aa		32.58	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	KCNQ4	P56696	695 aa		32.58	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.58	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	LY75	O60449	1722 aa		32.57	■■■□□ 2.81
USP36-224	ENST00000592907	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	EYA1	Q99502	592 aa		32.55	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8	3e-11	■□□□□ 8.5
USP36-224	ENST00000592907	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.54	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.53	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	PANK3	Q9H999	370 aa		32.52	■■■□□ 2.8
USP36-224	ENST00000592907	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.5	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.5	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.49	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	POLD1	P28340	1107 aa		32.49	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.49	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
USP36-224	ENST00000592907	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.43	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	PIGB	Q92521	554 aa		32.43	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.41	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.41	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.4	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.4	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	PHKG2	P15735	406 aa		32.4	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.4	■■■□□ 2.78
USP36-224	ENST00000592907	UTRN	P46939	3433 aa		32.38	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	MSH5	O43196	834 aa		32.36	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.36	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	C5	P01031	1676 aa		32.35	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.35	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.34	■■■□□ 2.77
USP36-224	ENST00000592907	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.32	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	SIK1	P57059	783 aa		32.32	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	ITGB4	P16144	1822 aa		32.32	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	AK7	Q96M32	723 aa		32.31	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.29	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.29	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.28	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.27	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.27	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	GPR162	Q16538	588 aa		32.27	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.26	■■■□□ 2.76
USP36-224	ENST00000592907	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.26	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.26	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	SSFA2	P28290	1259 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.24	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.24	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.21	■■■□□ 2.75
USP36-224	ENST00000592907	ITPK1	Q13572	414 aa		32.21	■■■□□ 2.75

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