RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
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PSME3-211ENST00000591152 USP54Q70EL1 1684 aa29.76■■■□□ 2.35
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PSME3-211ENST00000591152 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.74■■■□□ 2.35
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PSME3-211ENST00000591152 PALLDQ8WX93 1383 aa29.52■■■□□ 2.32
PSME3-211ENST00000591152 PHF14O94880 888 aa29.52■■■□□ 2.32
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PSME3-211ENST00000591152 PIGBQ92521 554 aa29.37■■■□□ 2.29
PSME3-211ENST00000591152 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.36■■■□□ 2.29
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PSME3-211ENST00000591152 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
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PSME3-211ENST00000591152 BCS1LQ9Y276 419 aa29.32■■■□□ 2.28
PSME3-211ENST00000591152 ITGB4P16144 1822 aa29.31■■■□□ 2.28
PSME3-211ENST00000591152 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.31■■■□□ 2.28
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PSME3-211ENST00000591152 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.31■■■□□ 2.28
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PSME3-211ENST00000591152 INSRP06213 1382 aa29.29■■■□□ 2.28
PSME3-211ENST00000591152 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.29■■■□□ 2.28
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PSME3-211ENST00000591152 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.27■■■□□ 2.28
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PSME3-211ENST00000591152 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PSME3-211ENST00000591152 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PSME3-211ENST00000591152 FCHSD2O94868 740 aa29.21■■■□□ 2.27
PSME3-211ENST00000591152 SPG7Q9UQ90 795 aa29.21■■■□□ 2.27
PSME3-211ENST00000591152 DPEP1P16444 411 aa29.2■■■□□ 2.26
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