RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589424.5

USP36-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP36, Length 970 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-216ENST00000589424 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
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USP36-216ENST00000589424 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
USP36-216ENST00000589424 NSD2O96028 1365 aa27.58■■■□□ 2.01
USP36-216ENST00000589424 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2
USP36-216ENST00000589424 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
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USP36-216ENST00000589424 AKT1S1Q96B36 256 aa27.56■■■□□ 2
USP36-216ENST00000589424 NBPF4Q96M43 638 aa27.56■■■□□ 2
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USP36-216ENST00000589424 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.55■■■□□ 2
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USP36-216ENST00000589424 ARXQ96QS3 562 aa27.54■■■□□ 2
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USP36-216ENST00000589424 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.48■■□□□ 1.99
USP36-216ENST00000589424 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.47■■□□□ 1.99
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USP36-216ENST00000589424 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.44■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.43■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.43■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.43■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 ITGB4P16144 1822 aa27.43■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.42■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 POLD1P28340 1107 aa27.41■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.4■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 KLHL34Q8N239 644 aa27.39■■□□□ 1.98
USP36-216ENST00000589424 NCAPD2Q15021 1401 aa27.39■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 CYP27B1O15528 508 aa27.37■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 PALLDQ8WX93 1383 aa27.35■■□□□ 1.97
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USP36-216ENST00000589424 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.34■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 MSH5O43196 834 aa27.33■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
USP36-216ENST00000589424 GPR162Q16538 588 aa27.32■■□□□ 1.96
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USP36-216ENST00000589424 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.29■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 MSL1Q68DK7 614 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 EYA1Q99502 592 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 SPG7Q9UQ90 795 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-216ENST00000589424 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 POLKQ9UBT6 870 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 PIGBQ92521 554 aa27.24■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-216ENST00000589424 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.953e-11■□□□□ 8.5
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USP36-216ENST00000589424 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.19■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.18■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 PHKG2P15735 406 aa27.17■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.941e-7■■□□□ 13.6
USP36-216ENST00000589424 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.16■■□□□ 1.94
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USP36-216ENST00000589424 SIK1P57059 783 aa27.16■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.16■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.15■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 PHF14O94880 888 aa27.15■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 SMIM5Q71RC9 77 aa27.14■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.14■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.14■■□□□ 1.94
USP36-216ENST00000589424 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.14■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 PANK3Q9H999 370 aa27.13■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.13■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 GRIN3BO60391 1043 aa27.12■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 SSFA2P28290 1259 aa27.11■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 ITPK1Q13572 414 aa27.11■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.09■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 ATG3Q9NT62 314 aa27.09■■□□□ 1.93
USP36-216ENST00000589424 ATP6V1AP38606 617 aa27.08■■□□□ 1.93
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