RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.06■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.923e-7■□□□□ 9.9
ATG4D-208ENST00000588667 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.05■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 KDRP35968 1356 aa27.04■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 SBF2Q86WG5 1849 aa27.03■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 BCL9O00512 1426 aa27.03■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
ATG4D-208ENST00000588667 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
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ATG4D-208ENST00000588667 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27■■□□□ 1.91
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC125Q86Z20 511 aa26.99■■□□□ 1.91
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ATG4D-208ENST00000588667 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.98■■□□□ 1.91
ATG4D-208ENST00000588667 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
ATG4D-208ENST00000588667 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.98■■□□□ 1.91
ATG4D-208ENST00000588667 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.98■■□□□ 1.91
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ATG4D-208ENST00000588667 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
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ATG4D-208ENST00000588667 SPG7Q9UQ90 795 aa26.96■■□□□ 1.91
ATG4D-208ENST00000588667 NUDCQ9Y266 331 aa26.96■■□□□ 1.91
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ATG4D-208ENST00000588667 NHSQ6T4R5 1651 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM37O94972 964 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4D-208ENST00000588667 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
ATG4D-208ENST00000588667 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.91■■□□□ 1.9
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ATG4D-208ENST00000588667 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.9■■□□□ 1.9
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ATG4D-208ENST00000588667 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.86■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 PHKG2P15735 406 aa26.85■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.85■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.85■■□□□ 1.89
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ATG4D-208ENST00000588667 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 BTAF1O14981 1849 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.83■■□□□ 1.89
ATG4D-208ENST00000588667 KCNQ2O43526 872 aa26.82■■□□□ 1.88
ATG4D-208ENST00000588667 FCHSD2O94868 740 aa26.82■■□□□ 1.88
ATG4D-208ENST00000588667 ITGB4P16144 1822 aa26.82■■□□□ 1.88
ATG4D-208ENST00000588667 APBA3O96018 575 aa26.81■■□□□ 1.88
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ATG4D-208ENST00000588667 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG4D-208ENST00000588667 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.8■■□□□ 1.88
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ATG4D-208ENST00000588667 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.77■■□□□ 1.88
ATG4D-208ENST00000588667 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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ATG4D-208ENST00000588667 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 PLSCR1O15162 318 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 RREB1Q92766 1687 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG4D-208ENST00000588667 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
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ATG4D-208ENST00000588667 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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ATG4D-208ENST00000588667 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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ATG4D-208ENST00000588667 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.7■■□□□ 1.86
ATG4D-208ENST00000588667 MRS2Q9HD23 443 aa26.7■■□□□ 1.86
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ATG4D-208ENST00000588667 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.67■■□□□ 1.86
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ATG4D-208ENST00000588667 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.66■■□□□ 1.86
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ATG4D-208ENST00000588667 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
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ATG4D-208ENST00000588667 TXNRD1Q16881 649 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 PROM2Q8N271 834 aa26.61■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 PALLDQ8WX93 1383 aa26.61■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 NFE2L2Q16236 605 aa26.6■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.6■■□□□ 1.85
ATG4D-208ENST00000588667 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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