RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTIF-206ENST00000588345 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-206ENST00000588345 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.39■■□□□ 1.66
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.38■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB7AO95365 584 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 PTGER2P43116 358 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 NSD2O96028 1365 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 LY75O60449 1722 aa25.35■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.35■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 MTFR1LQ9H019 292 aa25.34■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.34■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.34■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 NCAPD2Q15021 1401 aa25.33■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 ZNF827Q17R98 1081 aa25.33■■□□□ 1.65
CTIF-206ENST00000588345 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.642e-12■■■■■ 51.9
CTIF-206ENST00000588345 AKT1S1Q96B36 256 aa25.31■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.31■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.29■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.29■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.29■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.29■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTIF-206ENST00000588345 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.26■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 POLKQ9UBT6 870 aa25.25■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.25■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 CYP27B1O15528 508 aa25.24■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.24■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.23■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.22■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.22■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 KCNQ4P56696 695 aa25.22■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.22■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 SYT17Q9BSW7 474 aa25.21■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTIF-206ENST00000588345 EYA1Q99502 592 aa25.2■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 ITGB4P16144 1822 aa25.2■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K5Q99683 1374 aa25.19■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 ARXQ96QS3 562 aa25.19■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 PANK3Q9H999 370 aa25.19■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.18■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 C5P01031 1676 aa25.17■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 SPG7Q9UQ90 795 aa25.16■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.16■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.16■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 YY1P25490 414 aa25.15■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 PALLDQ8WX93 1383 aa25.15■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.14■■□□□ 1.62
CTIF-206ENST00000588345 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.11■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 POLD1P28340 1107 aa25.1■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 PIGBQ92521 554 aa25.1■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 PHKG2P15735 406 aa25.08■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.08■■□□□ 1.61
CTIF-206ENST00000588345 C4BP0C0L5 1744 aa25.07■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 MORC1Q86VD1 984 aa25.05■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.04■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.04■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.03■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.02■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 CHD4Q14839 1912 aa25.02■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.02■■□□□ 1.6
CTIF-206ENST00000588345 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 MSH5O43196 834 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 SIK1P57059 783 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 AK7Q96M32 723 aa24.98■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.98■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.97■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 KLHL34Q8N239 644 aa24.97■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.96■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.96■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.96■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 DCAF5Q96JK2 942 aa24.96■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 ATG3Q9NT62 314 aa24.96■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 KDRP35968 1356 aa24.95■■□□□ 1.59
CTIF-206ENST00000588345 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.95■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 MSL1Q68DK7 614 aa24.95■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.95■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 IL13P35225 146 aa24.94■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 ITPK1Q13572 414 aa24.94■■□□□ 1.58
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