RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF4-216ENST00000586813 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.05■■□□□ 1.92
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TRAF4-216ENST00000586813 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.04■■□□□ 1.92
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TRAF4-216ENST00000586813 AKT1S1Q96B36 256 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF4Q96M43 638 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.02■■□□□ 1.92
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TRAF4-216ENST00000586813 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.92■■□□□ 1.9
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TRAF4-216ENST00000586813 PHF14O94880 888 aa26.61■■□□□ 1.85
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TRAF4-216ENST00000586813 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.6■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 SSFA2P28290 1259 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 SMIM5Q71RC9 77 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 GRIN3BO60391 1043 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAF4-216ENST00000586813 ITPK1Q13572 414 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAF4-216ENST00000586813 ATG3Q9NT62 314 aa26.57■■□□□ 1.84
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