RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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TRAF4-216ENST00000586813 CDCA8Q53HL2 280 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 AKT1S1Q96B36 256 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF4Q96M43 638 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAF4-216ENST00000586813 INSRP06213 1382 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 FLT4P35916 1363 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 SYT17Q9BSW7 474 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 UTRNP46939 3433 aa27.01■■□□□ 1.91
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TRAF4-216ENST00000586813 ARXQ96QS3 562 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K5Q99683 1374 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 KCNQ4P56696 695 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAF4-216ENST00000586813 CHD4Q14839 1912 aa26.96■■□□□ 1.91
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TRAF4-216ENST00000586813 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 ITGB4P16144 1822 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 NCAPD2Q15021 1401 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAF4-216ENST00000586813 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAF4-216ENST00000586813 POLD1P28340 1107 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAF4-216ENST00000586813 CYP27B1O15528 508 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAF4-216ENST00000586813 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAF4-216ENST00000586813 PALLDQ8WX93 1383 aa26.83■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 KLHL34Q8N239 644 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 C4BP0C0L5 1744 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 MSH5O43196 834 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAF4-216ENST00000586813 GPR162Q16538 588 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.76■■□□□ 1.87
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TRAF4-216ENST00000586813 POLKQ9UBT6 870 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 SPG7Q9UQ90 795 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 MSL1Q68DK7 614 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 PIGBQ92521 554 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAF4-216ENST00000586813 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.873e-6■□□□□ 10.9
TRAF4-216ENST00000586813 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 AK7Q96M32 723 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 PHKG2P15735 406 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 SIK1P57059 783 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAF4-216ENST00000586813 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.64■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 PANK3Q9H999 370 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.851e-7■■□□□ 13.9
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TRAF4-216ENST00000586813 PHF14O94880 888 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.6■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 SSFA2P28290 1259 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 SMIM5Q71RC9 77 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TRAF4-216ENST00000586813 GRIN3BO60391 1043 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAF4-216ENST00000586813 ITPK1Q13572 414 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAF4-216ENST00000586813 ATG3Q9NT62 314 aa26.57■■□□□ 1.84
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